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En utilisant le critère d'information d'Akaike marginal (mAIC) introduit par Susko et al., cette étude démontre que les modèles de mélange surpassent systématiquement les modèles partitionnés pour l'analyse phylogénétique de données d'acides aminés, justifiant ainsi leur développement futur.
Cette étude démontre que chez la punaise des lits, l'organe reproducteur féminin novateur appelé spermalege assume des fonctions d'immunisation et de traitement de l'éjaculat, tandis que la réponse transcriptionnelle post-mating du tractus génital est retardée et déclenchée spécifiquement par l'arrivée des spermatozoïdes plutôt que par l'acte d'accouplement lui-même.
Cette étude démontre que chez Drosophila, la dominance cis-régulatrice interallélique, médiée par des hubs transcriptionnels et la transvection, permet de masquer les variants délétères tout en favorisant l'innovation évolutive en élargissant les trajectoires mutationnelles accessibles aux génomes diploïdes.
L'analyse du génome de 12 populations d'*E. coli* issues de l'expérience d'évolution à long terme de Lenski révèle que l'adaptation suit une séquence temporelle précise, passant de gènes liés à la croissance à des gènes de survie, avec un déclin général des taux d'évolution et des gains de fitness qui illustre la loi du rendement décroissant.
Cette étude démontre que, bien que les traits fonctionnels clés de l'isopode *Asellus aquaticus* n'aient pas évolué de manière divergente sous l'effet combiné du réchauffement et de la prédation, la fonction écosystémique de décomposition a subi une évolution rapide et distincte, révélant ainsi l'impact direct des changements globaux sur la dynamique éco-évolutive des écosystèmes.
En utilisant un modèle de données microbiennes, cette étude démontre que les prédictions de la dynamique adaptative et de la génétique des populations divergent souvent dans les interactions interspécifiques, en particulier lors de la coexistence stable, en raison des effets du temps fini, de l'apport de mutations et des tailles de population.
Cette étude démontre que la variation locale de la taille des groupes modifie la dynamique de parenté liée à l'âge et les pressions de sélection sur les comportements sociaux, favorisant des stratégies d'entraide ou de nuisance plus extrêmes et précoces dans les petits groupes, ce qui éclaire l'évolution de traits comme la ménopause chez les mammifères sociaux.
Cette étude démontre que les poissons épinoches d'eau douce ont rapidement et à plusieurs reprises développé une expansion du nombre de copies du gène MYH3C, impliquée dans le développement musculaire, via des duplications tandem sur le chromosome sexuel, ce qui constitue un exemple de divergence adaptative médiée par des variants de nombre de copies.
Cette étude caractérise les signatures transcriptionnelles divergentes des champignons endophytes et pathogènes du blé lors de la colonisation précoce, révélant que *Gaeumannomyces hyphopodioides* déclenche une reprogrammation génétique et une réponse au stress favorisant la défense de l'hôte, tandis que *G. tritici* adopte un profil d'expression furtif et une dégradation de la lignine pour contourner les défenses et persister.
Cette étude comparative de trois espèces d'arbres boréaux en Suède révèle que, malgré des histoires de colonisation et des régimes de flux génique distincts, elles partagent une zone de contact nord-sud alignée sur des gradients environnementaux, tout en présentant des architectures génétiques d'adaptation locale variées allant de loci dispersés à des inversions chromosomiques spécifiques.
Cette étude cartographie la diversité génomique de 46 espèces de grenouilles en Amérique du Nord à l'aide de données génomiques de 2 481 individus, révélant des gradients latitudinaux fréquents et proposant un cadre pour identifier les zones prioritaires de conservation.
Cette étude démontre que le transfert horizontal de plasmides chez *Acinetobacter baylyi* accélère la ségrégation des allèles plasmidiques en favorisant l'émergence de cellules homoplasiques, révélant ainsi un mécanisme évolutif clé pour les éléments génétiques mobiles.
Cette étude révèle que chez la plante *Spirodela polyrhiza*, des polymorphismes de transposons anciens, et non des SNPs, sous-tendent l'adaptation écologique mondiale au froid malgré une diversité nucléotidique chroniquement faible, résolvant ainsi un paradoxe évolutif.
Cette étude propose une nouvelle méthode basée sur les données de polymorphisme pour estimer la force de la sélection naturelle sur les mutations synonymes chez *Drosophila melanogaster*, révélant que bien que cette sélection soit généralement faible, elle est détectable et validée par sa corrélation avec l'usage des codons, l'expression génique et la stabilité de la structure secondaire de l'ARNm.
En étendant le jeu de la Chasse au Cerf à des populations croissantes et à des récompenses multiples, ce modèle théorique propose une « échelle de coopération » où l'interaction entre la démographie et des seuils de gains explique les trajectoires historiques divergentes des sociétés, alternant entre des surges de coopération, des stagnations et des régressions dues au passager clandestin.
Cet article propose une nouvelle méthode d'inférence sans vraisemblance combinant des outils d'ABC pour estimer simultanément la force de la sélection et le nombre de loci sélectionnés dans une population évolutive, en surmontant les défis posés par les corrélations génomiques et en quantifiant l'incertitude via des données simulées et réelles.
Cette étude révèle que les archées Asgard possèdent des transporteurs de phospholipides de la famille StarAsg1, structurellement et fonctionnellement similaires aux protéines de transfert lipidiques eucaryotes, suggérant que ces mécanismes préexistaient à l'émergence des organites et ont facilité l'origine des cellules eucaryotes.
Cette étude présente une analyse bioinformatique intégrée révélant l'origine évolutive de la thyroglobuline à partir d'un précurseur de type nidogène et démontrant la conservation structurelle et fonctionnelle de ses domaines complexes chez les vertébrés, y compris chez la lamproie marine.
Cette étude révèle que la diversité des fibres caudales des carotovoricines chez le genre *Pectobacterium* est maintenue par un mécanisme de recombinaison homologue à l'échelle du genre, permettant un échange ciblé de ces gènes qui façonne les interactions communautaires entre ces phytopathogènes.
Le papier présente pylifemap, un package Python permettant de visualiser et d'explorer interactivement des données biologiques variées en les superposant à l'arbre de la vie de NCBI via le projet Lifemap.